У предрасположенности к тяжелому ковиду нашли этнические особенности

Гены и содержащие их хромосомные локусы, выявленные в метаанализе (статистически значимые — над пунктирной линией)

Китайские ученые
обнаружили у своих соотечественников несколько генетических вариантов,
связанных с тяжелым течением ковида. Использовав полученные данные и результаты
предыдущих исследований, они провели межэтнический метаанализ подобных
взаимосвязей. Он подтвердил связь тяжелого заболевания с некоторыми регуляторными
генами приобретенного иммунитета и группой крови системы АВ0, а также впервые выявленным
редким генетическим вариантом, специфичным для китайцев. Публикация об этом появилась в
журнале Communications Biology.

Восприимчивость к
различным инфекциям и тяжесть развившегося заболевания зачастую зависят от
врожденных особенностей человека. Классическими примерами этого служат связи
генов CCR5 с ВИЧ-инфекцией, ABO с малярией и HLA-C с хроническим вирусным гепатитом В. Столкнувшись с пандемией
ковида, ученые из разных стран начали вести подобные исследования и в отношении
этой инфекции, в том числе в рамках масштабной Инициативы
по изучению генетических особенностей при ковиде (COVID-19 HGI). На данный момент лучше всего изучена корреляция
тяжелого течения инфекции с определенным гаплотипом хромосомного локуса 3p21.31, содержащего несколько регуляторных
генов иммунной системы; обнаружены и другие взаимосвязи.

До сих пор
подобные работы велись в основном среди добровольцев европейского
происхождения. Из-за этого их результаты не всегда можно экстраполировать на
другие этнические группы. К примеру, упомянутый гаплотип 3p21.31 имеет неандертальское происхождение
и распространен среди южноазиатского (30 процентов) и европейского (8 процентов)
населения, но практически отсутствует у восточноазиатского.

Группа
исследователей из различных научных центров Китая под руководством Чаолуна Вана
(Chaolong Wang) из Хуачжунского научно-технологического
университета решила восполнить этот пробел. С этой целью ученые генотипировали
вирус и секвенировали ДНК у пациентов Больницы Тунцзи в Шанхае и Хубэйской больницы
традиционной китайской медицины в Ухане с тяжелым и легким течениями ковида. К
этому добавили данные здоровых членов этнодемографически схожей когорты Coke Oven Worker, добытые аналогичными методами.

После отсеивания
данных ненадлежащего качества в аналитическую выборку включили 2858 человек.
598 с тяжелым течением ковида вошли в основную группу, 859 с легким течением и
1401 здоровых — в контрольную. Всем им выполнили полногеномный поиск ассоциаций
(GWAS). Результаты добавили к данным
GWAS, полученным у 3199
госпитализированных пациентов и почти 897,5 тысячи здоровых участников COVID-19 HGI для метаанализа.

Помимо локуса 3p21.31, широко представленного только в
европеоидной популяции COVID-19
HGI, исследователи обнаружили
три значимые ассоциации. Они включали интронный вариант гена онкогенной длинной
некодирующей РНК FOXP4-AS1 в локусе 6p21.1 (ОШ 1,28; р = 2,51×10−10; отношение частот аллелей у китайцев и
европейцев 0,345/0,105)
и сдвиг рамки считывания в отвечающем за основные
группы крови гене ABO в локусе 9q34.2 (ОШ
1,19; р = 8,98×10−9;
отношение частот аллелей 0,422/0,395). Третьей находкой стал специфичный
для китайцев редкий интронный вариант гена фактора транскрипции, принимающего
участие в функционировании лимфоцитов и мышц, реакции на стресс и развитии
некоторых опухолей крови, — MEF2B в локусе 19q13.11 (ОШ 8,73; р = 1,22×10−8; отношение частот аллелей 0,004/0).

Таким образом,
исследователи, с одной стороны, подчеркнули важную роль системы приобретенного
иммунитета и групп крови AB0 в тяжести
течения ковида, а с другой — что за это отвечают генетические варианты как
общие для всех людей, так и присущие только отдельным этническим группам.
Авторы работы выразили надежду, что в будущем полученные результаты помогут в
разработке таргетных
стратегий профилактики и лечения ковида.

В ходе текущей
пандемии выяснилось, что у многих пациентов ковид оставляет длительный «шлейф»
отдаленных симптомов (об этом наш материал «Долгие проводы»), и в их числе, что вызывает отдельную
озабоченность, — нарушения со стороны центральной нервной системы (а об этом — «Туманный диагноз»).

О насущной
проблеме прогнозирования новых опасных мутаций коронавируса мы рассказывали в
материале «Страньше
и страшнее».

Олег
Лищук

Источник: nplus1.ru

0 0 голоса
Рейтинг статьи

Опубликовано: 02.09.2021 в 22:46

Автор:

Категории: Наука и технологии

Подписаться
Уведомить о
guest
0 комментариев
Межтекстовые Отзывы
Посмотреть все комментарии